Makopsé est situé au nord-est du raïon de Lazarevskoïe, le long de la rivière Makopsé et de son embouchure dans la mer Noire, ainsi que dans les collines environnantes. Ses rues principales sont la rue Maïskaïa (rue de Mai), Koltsova (circulaire), Gretcheskaïa (rue Grecque), Jasminnaïa ...